Après avoir jeté par dessus bord leur équipage suite à une mutinerie, Le Capitaine Tracasse et Monsieur Surplouf son second, espiègle mais maladroit, se retrouvent bien démunis.
Le navire au mouillage, ils ont réuni de jeunes moussaillons (le public) pour former un nouvel équipage. Seulement, à bord de " l'Aigle des mers ", il ne peut y avoir de marins d'eau douce, de poules mouillées ni de corsaires en plastique.
Les apprentis pirates devront passer des épreuves pour déterminer s'ils ont les compétences requises "pour faire de bons pirates". Nos deux flibustiers n'hésiteront pas à faire usage de magie, de jonglerie et d'humour pour retourner écumer les océans.