Arnolphe veut épouser Agnès, sa pupille, qu'il a fait élever dans un couvent avec ordre de ne lui donner aucune instruction si ce n'est l'apprentissage des tâches incombant à une bonne épouse.
En attendant le mariage, il la confie à Alain et Georgette, couple simple et naïf, leur demandant d'isoler la jeune femme. Malgré cela, Agnès rencontre Horace, fils d'un ami à lui. L'amour les frappe en plein coeur. Horace, ignorant le projet d'Arnolphe, se confie à lui.
Furieux, Arnolphe décide de précipiter le mariage en inculquant à Agnès le sentiment de culpabilité et lui apprenant par la force, des maximes sur les devoirs de la femme ... Lilith, soeur d'Arnolphe et femme rebelle, se dresse face au manège de son frère et à ses dogmes, grâce à Chrysalde, ami libertin d'Arnolphe.

Lilith et Agnès se déroule dans le milieu du cirque, un univers ludique de bande dessinée, un décor coloré et lumineux peuplé de personnages hauts en couleurs. Le tout dans une mise en scène joyeuse, dynamique et actuelle.

Tout en gardant le style et les expressions de l'auteur, les vers se sont transformés en prose.

Le maintien dans l'ignorance et la limitation du savoir pour mieux manipuler, la destruction de l'esprit critique, le pouvoir des dogmes, la puissance de l'emprise, tels sont les différents thèmes traités dans la pièce.