Le Prince Tamino tombe amoureux de la belle Pamina après avoir vu son portrait. La Reine de la Nuit, mère de Pamina, envoie Tamino délivrer sa fille des mains de son ennemi, Sarastro, le Grand-Prêtre d'Isis. Papageno, un sympathique attrapeur d'oiseaux, accompagne le Prince. Ils reçoivent respectivement une flûte enchantée et un jeu de clochettes magiques pour les protéger du danger.

Dans le temple de Sarastro, Pamina résiste à la violence de l'affreux Monostatos, auquel l'arrivée de Papageno flanque une sacrée frousse. Entretemps, Tamino a rencontré les Prêtres de Sarastro et a décidé de leur obéir. Sarastro invite Tamino, qui a enfin rencontré Pamina, à subir des épreuves grâce auxquelles il prouvera sa valeur. Malgré toutes sortes de tentations, Tamino demeure stoïque et, accompagné de Pamina, subit les épreuves avec courage.

La Reine de la Nuit, furieuse, tente d'exiger de sa fille qu'elle assassine Sarastro, mais c'est elle qui est précipitée dans les ténèbres éternelles. Et tandis que Papageno trouve enfin sa petite Papagena, Tamino et Pamina sont admis dans le Temple des Initiés.

Le Saviez-vous?
Cultissimes dans le monde entier depuis 1913, les fameuses marionnettes à fil sont un des emblèmes de la ville de Mozart.